Patógenos: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Bacillus anthracis, Corynebacterium diphtheriae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, etc.
No patogenos o saprofitos: Sthaphylococcus epidermidis, Streptocuccus viridans, Micrococcus sp. Bacillus subtilis, etc.
Beneficiosos, hongos como Penicillum sp (produce la penicilina), no me acuerdo de mas

Incompleto estás tu amigo ¿que haces estudiando microbiologia sin saber escribir?. Aprende primero ortografia...

Le dan el nombre segun el descubridor, le dan el nombre a la enfermedad, segun los cuadros clinicos que presentan los pacientes enfermos, por ejemplo, Virus del Ebola, de Epstein barr, Citomegalovirus, el virus de la hepatitis, virus sincitial respiratorio, el virus de la influenza, que lo pueden confundir los que no entienden de ciencias medicas con el Haemophillus influenzae, bacteria que provoca el catarro o influenza bacteriana, El actual virus que ataca al mundo, el de la influenza A1, es un serotipo, es decir, el virus de la influenza esta en todas partes del mundo, sin embargo, cada año muta y por eso cada año estamos expuestos a enfermarnos nuevamente de gripa, por que nuestros anticuerpos no reconocen al nuevo agente mutado, sin embargo, se clasifican, el H1N1 actual, ya habia aparecido desde 1950, pero desaparecio (o mejor dicho se inactivo por un tiempo), ahoa se volvio a encontrar el H1N1 en pacientes que, desgraciadamente fallecieron por alguna complicacion, la clasificacion de H1N1 se da por la capa o pared que envuelve a un virus, busca la imagen en 3D de un virus y te daras cuenta como vienen esquematizadas por colores, la H corresponde a la Hialuronidaza y la N a la Neuroaminidasa, estas pueden cambiar y de ahí sacamos el numero que le corresponda, 1,2,3,4,5, etc...

el nombre en el caso de los virus es al subtipo que en esta caso es A, porque afecta a los humanos y el H es HEMAGLUTININA Y LA N NEURAMINIDASA y los numeros son en base a los animales que la transmiten al humano.